22 августа 1951 года приказом Военно-морского министра СССР вице-адмирала Н. Г. Кузнецова был принят на вооружение самолет Бе-6 в качестве дальнего морского разведчика. В 403-й отдельный морской дальнеразведывательный авиационный полк (омдрап) ВВС Северного флота первый опытный самолет Бе-6 поступил в июне 1951 года из НИИ-15 авиации ВМС, который находился в то время в Риге. На нем и приступили к переучиванию. Через год из того же НИИ заместитель командира эскадрильи 403-го омдрап майор Лившиц перегнал на север еще одну машину. Местом базирования гидросамолетов стала губа Грязная. В числе первых на Бе-6 переучились летчик-инструктор ВВС СФ майор В.Галдин и заместитель командира 403-го авиаполка ВВС СФ по летной подготовке майор А.Козлов. Экипажи разведывательного полка ВВС Северного флота привлекались к обеспечению испытаний ядерного оружия, активно проводившихся в 1950-х годах на архипелаге Новая Земля. Экипажи Бе-6 вели воздушную разведку с целью обнаружения иностранных кораблей в прилегающей к району испытаний акватории. Некоторые пролетали сквозь радиоактивное облако через определенные промежутки времени для изучения характера спада радиоактивности. По воспоминаниям штурмана полка 403-го омдрап ВВС Северного флота полковника Л.Терещенко, большое внимание уделялось разведывательной подготовке и полетам на поддержание оперативного режима. Такие полеты продолжались по 8-10 часов, в полку имелись самолеты и с дополнительными баками, которые могли находиться в воздухе до 18-20 часов, при этом на борту находились два экипажа. Радиус полета Бе-6 позволял обследовать значительные по площади районы Баренцева, Гренландского и Карского морей. По воспоминаниям летчиков и штурманов, в таких полетах они достигали остров Шпицберген.