Пока от ИИ ждут конца света, он спасает человечество – от супербактерий 🦠 Пока миллионы инвесторов и ИТ-специалистов читают в проспекте для IPO компании Anthropic, что развитие искусственного интеллекта может представлять угрозу человечеству, ИИ не обижается и помогает учёным решать настоящую глобальную проблему – уничтожать супербактерии, устойчивые к антибиотикам. Медики из США, Греции и Индии впервые разработали новый пептид CIT8 с выраженным антимикробным действием с помощью ИИ. В лабораторных экспериментах он уничтожил опасную Acinetobacter baumannii – одну из самых опасных бактерий, вызывающих в больницах по всему миру пневмонии, сепсисы и другие болезни с летальным исходом. К сожалению, современные антибиотики на неё практически не действуют. Почему это важно? Бактерии эволюционируют и приобретают устойчивость к существующим лекарствам. Новые антибиотики появляются редко, а принципиально новые классы антибактериальных препаратов последний раз открыли в 1987 году. За прошедшие 40 лет некоторые бактерии адаптировались к существующим антибиотикам. Раньше антибиотики находили в природе, но, похоже, они исчерпаны. Теперь вся надежда только на синтезируемые лекарства. Но чтобы понять структуру, которая уничтожит бактерию, и создать её – это значит научиться управлять структурами из десятков молекул и сотен атомов. Очень сложно для моделирования «в лоб», нереально для синтеза. Поэтому учёные оптимизировали решение. До создания CIT8 учёные проанализировали почти 15 000 антимикробных пептидов, в которых с помощью машинного обучения выявили закономерности между последовательностями аминокислот (молекул, составляющих пептиды и белки) и свойствами пептидов. Они выбрали природный антимикробный пептид и усилили его действие – рассчитали взаимодействие системы из 92 000 атомов, чтобы понять, как стабилизировать элемент молекулы (α-спираль), которая хорошо взаимодействует с мембраной супербактерии и вызывает фатальную утечку соединения АТФ, необходимого для жизни. По нашим оценкам, понадобилось несколько суток расчётов на GPU-сервере, поэтому, скорее всего, вычисления делались в облаке. Оказалось, что надо сократить пептид на пару аминокислот. После этого был синтезирован CIT8 и проверен в лабораторных условиях. Новый пептид ещё должен доказать свою безопасность и эффективность как лекарство. Однако это показательный пример того, как ИИ помогает в борьбе с угрозами человечеству, с которыми традиционная фармакология справляется всё труднее. 🖼 Иллюстрация: расчёт структуры пептида (источник).