💡 Исследователи из Петербургского института ядерной физики имени Б.П. Константинова НИЦ «Курчатовский институт» и Санкт-Петербургского государственного университета впервые раскрыли трехмерную структуру бактериального фермента RelSeq в комплексе с сигнальной молекулой pppGpp. Работа выполнена при поддержке Российского научного фонда. При нехватке питательных веществ, действии антибиотиков и других стрессовых факторов бактерии запускают так называемый строгий ответ — защитную программу, которая помогает им пережить неблагоприятные условия. Ключевую роль в этом процессе играет фермент RelSeq, синтезирующий и расщепляющий сигнальные молекулы (p)ppGpp. Они перестраивают обмен веществ, замедляют рост клеток и повышают их устойчивость к стрессу. Чтобы понять, как можно нарушить работу этой системы, ученые выделили фермент RelSeq, получили его кристаллы в комплексе с молекулой pppGpp и определили их пространственную структуру. ✔️ Было показано, что pppGpp связывается сразу с несколькими участками фермента, отвечающими как за синтез, так и за разрушение сигнальной молекулы. Кроме того, компьютерное моделирование выявило высокую структурную подвижность RelSeq и позволило определить наиболее важные участки связывания. ✔️ Обнаруженные сайты взаимодействия могут стать перспективными мишенями для новых противомикробных соединений. Блокируя работу RelSeq, такие препараты потенциально смогут нарушать способность бактерий адаптироваться к стрессу и повышать эффективность борьбы с устойчивыми инфекциями. «Важно подчеркнуть, что фермент RelSeq не имеет близких аналогов у человека, что делает его перспективной мишенью для разработки лекарственных средств. Поэтому полученные данные о его структуре в комплексе с сигнальными молекулами несомненно прольют свет на механизмы адаптации бактерий к стрессовым условиям, что важно при разработке новых препаратов против бактериальных инфекций. В дальнейшем мы планируем получить кристаллические структуры фермента в комплексе с другими сигнальными молекулами, а также провести ряд экспериментов с использованием компьютерного моделирования, чтобы подобрать потенциальные лекарственные средства и проверить их действие на активность RelSeq», — рассказывает Дарья Виноградова 📌 Результаты опубликованы в International Journal of Molecular Sciences 📌 Подробнее — в материале газеты «Коммерсант» 😊 РНФ | Телеграм | ВКонтакте | MAX #новостинауки_РНФ #биология