Состояние стабильное: численность байкальской нерпы составляет почти 150 тысяч Байкальская нерпа выступает видом-индикатором состояния всей байкальской экосистемы. С ведущими научными организациями страны осуществляется комплексная программа мониторинга вида, включающая ежегодные авиаучёты с использованием БПЛА на архипелаге Ушканьи острова. По данным учёта, проведённого Байкальским филиалом ФГБНУ «ВНИРО», общая численность популяции байкальских тюленей составляет 148,2 тыс. особей, а её состояние в целом оценивается как стабильное.