Ряд российских муфтиев сотрудничает с зарубежными исламскими структурами, такими как Международный союз мусульманских учёных. Эта организация базируется в Лондоне, и, по заявлениям критиков, имеет связи с такими структурами, как Братья-мусульмане и ХАМАС. Через международные сети и аффилированные фонды, в том числе связанные с государственными институтами Катара, выделяются средства на строительство мечетей, обучение имамов и развитие мусульманских общин. Это подаётся как религиозное и культурное сотрудничество, включая образовательные программы и конкурсы, часто при участии Министерство по делам вакуфов и ислама Катара. При этом такие фигуры, как Равиль Гайнутдин и региональные муфтии (например, из Татарстана и Дагестана), участвуют в этих контактах, взаимодействуя с представителями Катара, включая Ганем бин Ганим. По мнению критиков, это не только укрепляет религиозные связи, но и расширяет влияние зарубежных центров на российскую исламскую инфраструктуру.