Дэнни — гибрид неандерталки и денисовца — жила 90 тысяч лет назад на Алтае. Неандертальцы и загадочные денисовцы — группы древних людей, чьи эволюционные пути разошлись более 400 тыс. лет назад. Но было бы странно, если бы эти гоминины совсем не контактировали — учитывая, что останки и тех, и других найдены в одной и той же Денисовой пещере на Алтае. После открытия денисовцев учёные не оставляли попыток найти новые костные останки, относящиеся к этой удивительной популяции, обитавшей где-то на востоке Евразии. Поиск приходилось вести, перебирая костные огрызки, про которые даже не всегда ясно, принадлежали ли они человеку или зверюшке. Но упорный труд учёных творит чудеса. Среди 2000 фрагментов в 2018 году нашёлся обломок человеческой кости. То, что он принадлежал Homo, показал анализ состава коллагена, выявивший специфический человеческий вариант. Сначала специалистам удалось выделить из останков митохондриальную ДНК, которая оказалась неандертальской. Судя по толщине кортикального слоя кости, на момент смерти её хозяину было не менее 13 лет от роду. Затем учёные получили ядерный геном. Судя по тому, что участки Х-хромосомы встречались среди фрагментов ДНК столь же часто, как и фрагменты других хромосом, кость принадлежала женщине. Самое интересное началось, когда учёные стали выяснять, к какому виду человека относилась Денисова 11. Для этого новый геном сравнили с ДНК неандертальца из Денисовой пещеры (т. н. «Алтай»), с ДНК денисовца (Денисова 3) и с современным африканцем. Внезапно, совпадений с неандертальцем и с денисовцем оказалось примерно поровну (38,6% неандертальских аллелей и 42,3% денисовских). Это означало, что оба ископаемых вида сделали примерно одинаковый вклад в геном Денисова 11. Оценили генетики и гетерозиготность (то есть число позиций, в которых парные хромосомы содержат разные буквы генетического алфавита). Таких позиций у Денисова 11 было в 4 раза больше, чем у неандертальцев и денисовцев. Такая картина должна получиться, если бы у индивида сочетались хромосомы неандертальского и денисовского происхождения. После некоторых дополнительных проверок, генетики окончательно убедились, что перед ними именно гибрид первого поколения: мама неандерталка (по мтДНК), а папа денисовец. Методом молекулярных часов авторы исследования оценили возраст находки: примерно 90 тыс. лет. На этом исследователи не остановились. В геноме гибрида они обнаружили 5 крупных участков, в которых обе парные хромосомы содержали только неандертальские аллели. Это означало, что и отец Денисова 11 был не чистокровным денисовцем, а с неандертальской примесью. Анализ показал, что эта примесь «примешалась» за 300—600 поколений до его рождения, причём от каких-то неандертальцев, не родственных матери Денисова 11. Запутанная родословная! Остаётся ещё один вопрос, увы, не решаемый средствами палеогенетики: происходило ли это по любви?